APTonCDは現在、Ubuntu FeistyおよびDebianのtestingおよびunstableリポジトリに収録されているが、自分の使用しているディストリビューションからこれらを利用できない場合は、SourceForge.netからダウンロードすればいい。
デフォルト設定下のAPTonCDは、実行時点でAPTキャッシュにある任意のパッケージをCDに焼き込もうとするが、キャッシュ中のどのパッケージをCDに取り込ませるかはユーザが指定できるようになっている。ここで言うAPTキャッシュとは、Webブラウザにおける履歴キャッシュみたいなものと思えばいいだろう。実はapt-getやSynapticを使って新規パッケージをインストールした場合、その際にダウンロードされたパッケージファイルは、コマンドapt-get cleanを実行するまでキャッシュに残留し続けているのである。
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apt-get install パッケージ名 を使って、実際に該当するパッケージをインストールすることだ。既にシステムにインストール済みのパッケージをCDにバックアップしたい場合は、apt-getに-dオプションを指定してパッケージファイルのダウンロードをすることで、実際のインストールをすることなくキャッシュへの取り込みだけを行うことができる。
apt-get -d install パッケージ名
あるいは、各自のディストリビューションにはデフォルトで同梱されない依存ファイルもすべて含めた形で特定のパッケージをキャッシュに取り込みたい、というケースもあるだろう。その場合は、まずapt-get autoremove パッケージ名 によって当該パッケージをいったんアンインストールし、そのインストール時に自動ダウンロードされていた依存ファイルも削除しておく。そして改めてこれらのパッケージをインストールし直せば、該当するすべてのパッケージファイルがキャッシュに取り込まれるはずである。特に下記のコマンドを使うと、ユーザによる確認作業を省略した形でこれら2つの作業を一括して実行することができる。
apt-get -y autoremove パッケージ名 && apt-get -y install パッケージ名
キャッシュの準備が整ったら、次にAPTonCDを起動する。これ以降のCDへの焼き込みプロセスについては、特別注意すべき点はない。まずはCreate APTonCDをクリックする。そしてOptionsをクリックして使用するメディア（CDかDVD）および.isoファイルの名前を指定すれば、すべての準備は完了である。後はOKをクリックすると、APTonCDによる.isoファイルの作成が始まる。なおNautilus CD-burnerがインストールされたGNOMEデスクトップであれば、APTonCDから.isoの焼き込みを実行するかの確認メッセージが表示される。