Fireflyをインストールしたら、使い始める前に設定を行う必要がある。「ツール」→「アドオン」を選択し、リストからFireflyを探して「設定」をクリックする。Fireflyには、6画面分のオプションがある。「General」タブでは、隠しファイルの表示、ディレクトリおよびファイルの閲覧/選択が可能なサイドバーのデフォルト表示、オーディオファイルの自動再生といった項目が設定できる。また、サイズの大きなディレクトリをFireflyで表示すると動作が遅くなるので、ディレクトリスキャンの間隔を調整したり、ディレクトリサイズ算出やアイコン表示を無効化したりしてもよいだろう。ただし、最も重要なのは「Tree」タブで、Fireflyに表示させるディレクトリを設定することだ。それが済んだら、「Add」ボタンをクリックして表示対象ディレクトリの設定内容を保存しておく。
Fireflyを起動するには、Firefoxの「ツール」メニューから該当する項目を選択すればよい。「表示」→「ツールバー」->「カスタマイズ」を選択し、ドラッグで自作のFireflyアイコンをツールバーに追加することも可能だ。そうすれば、そのアイコンをクリックするだけでFireflyが立ち上がるようになる。
Fireflyでは、カレントウィンドウ上のファイルを左クリックすることでそのファイルを開くことができる。なお、HTMLおよびPDFファイルの内容はカレントウィンドウに表示される（ただし、PDFファイルの表示にはブラウザプラグインのインストールが必要）。マウスホイールをクリックすれば、選択したファイルを新しいタブで開くこともできる。ホイールなしマウスの場合は、右クリックでコンテキストメニューを開いて「Open」オプションを選択すれば同じことができる。
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| Firefly |
Fireflyのメインツールバーでは、ファイルパスやフィルタの指定ができる。このツールバーには、ファイルナビゲーション用の各種ボタン、画面の垂直および水平分割用のボタン、コピーおよびペースト用のボタンも並んでいる。表示モードは、旧来のHTMLブラウザのものと一般的なファイルマネージャのものがドロップダウンメニューから選べる。なお、HTMLモードでファイルを右クリックした場合は、ファイル用のオプションではなく、通常のFirefoxオプションが表示される。
非常に大きなディレクトリを開いている状態で表示モードの選択を行うと、Firefoxのフリーズやクラッシュが起こる可能性がある。また、サイドバーにちょっとした不具合が生じることがある。Fireflyのサイドバーからファイルを開こうとするとエラーメッセージが出るのに、そのあとでファイルのドロップダウンボックスからFirefoxアイコンを再選択すると同じファイルが正しく表示されたりする。また、デフォルトでサイドバーを表示する設定にしているかどうかに関係なく、サイドバーに何も表示されなくなることもある。この問題は、いったんサイドバーを閉じるか、ブラウザを再起動すれば解決される。従来のファイルビュー画面にアクセスしづらいという人でも、Fireflyのサイドバーを使えば、メインのブラウザ画面とは別のタブでディレクトリおよびファイルを表示して開くことができる。また、サイドバーから従来のファイルビュー画面を開いておけば、画像ファイルを探す際に「Thumbnail」ビューを選択すると、サムネイルが表示されると共に、各アイテムをスクロール形式で確認できる領域が画面の上部に表示される。この画面の表示対象もサイドバーから選択できる。