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FFFTPを起動すると、「ホスト一覧」画面が表示されます。この画面では、よく使う接続先ホストを登録しておくことができます。

「新規ホスト」をクリックすると、「ホストの設定」画面が表示されます。「設定名」には適当な名前を、「ホスト名（アドレス）」には接続先のホスト名もしくはIPアドレス、「ユーザ名」には接続に使用するユーザー名、「パスワード/パスフレーズ」には接続に使用するパスワードを入力します。また、「ローカルの初期フォルダ」および「ホストの初期フォルダ」では接続後に表示するフォルダを指定することができます。

「拡張」や「文字コード」、「ダイアルアップ」、「高度」ではそれぞれ高度な設定が行えますが、多くの場合はデフォルトの設定で問題ないでしょう。

「OK」をクリックすると「ホスト一覧」ウィンドウに設定したホストが追加されます。接続したいホストを選択し、「接続」をクリックするとホストへの接続が行われます。

のメイン画面では、左側にローカル側のファイル/フォルダ、右側にリモート側のファイル/フォルダが表示されます。ローカル側のファイル/フォルダを選択してツールバーの上矢印をクリックするとファイルのアップロード、リモート側のファイルを選択してツールバーの下矢印をクリックするとファイルのダウンロードが行えます。
また、右側のリモート側のファイル/フォルダが表示されているウイドウに、ローカル側のファイル/フォルダを直接ドラッグ＆ドロップすることでもアップロードが行えます。同様に、右側のリモート側のファイル/フォルダを、ローカル側の任意の場所（フォルダや、デスクトップなど）へ直接ドラッグ＆ドロップすることでもダウンロードが行えます。.