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Topic
    Scientific/Engineering
        Bio-Informatics

2091 projects in result set.
Displaying 20 per page. Projects sorted by activity ranking.

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LastUpdate: 2014-04-03 22:35
Jmol

Jmolは、Javaで作成された分子の3次元の化学構造を表示するためのプログラムです。さまざまな形式の構造データ・ファイルや量子化学計算プログラムによる出力結果及び複数フレームのアニメーション・ファイルや量子化学計算プログラムで計算された基準振動モードを読み込みむことができます。

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Activity Percentile: 99.99
Activity Ranking: 53
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LastUpdate: 2008-02-28 04:56
Magic Garden

Magic Gardenは、人工植物の研究室です。Lシステムの植物を作成し、それらをリアルタイムで変更することができます。OpenGLサポートの追加、アニメーション、何種類かの庭エディタが計画されています。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2003-05-13 17:02
Taverna

Tavernaは、純Javaオブジェクトモデル、モデルの事前準備のためのパーサー、( ワークフローを対応アプリケーションにドロップするためのSwingコンポーネントを含む)ビューとコントローラのセットを備えたScufl(簡易概念統一フロー言語)と呼ばれる高級言語を含むワークフロー制定と記述コンポーネントのコレクションです。実際にワークフローを実行するため、myGridワークフロー制定エンジンも必要です。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2004-01-31 11:30
Brook for GPUs

Brook for GPUsは、現代的なグラフィックハードウェアに対応した Brook ストリーム処理用プログラミング言語のコンパイラとランタイムの実装です。このプロジェクトの目的は GPU上の一般的プログラミングをデモンストレートすることと、GPU上でアプリケーションを走らせたい開発者向けに役に立つツールを提供すること、ストリーム処理用言語のプログラミングモデル、ストリーミングアプリケーション、システム実装を研究することです。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2007-02-03 07:17
Bioclipse

Bioclipse は、リッチ クライアント プラットフォーム化学、生物学ワークベンチです。多くのオープン ソースのバイオインフォマティクスとケモインフォマティクス ツールキットへのアクセスを提供し、化学開発のキット、JChemPaint、Jmol、および !BioJava のプラグインを持っています。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2007-05-21 21:44
Python Macromolecular Library

Python 高分子ライブラリ (mmLib) は、ソフトウェア ・ ツールキットと解析ルーチンのライブラリと高分子構造モデルでは、Python プログラミング言語で実装されている操作。それは、階層型、オブジェクト指向のアプリケーション プログラミング インターフェイス経由でアクセス mmCIF、PDB、および MTZ ファイルは、図書館の原子要素およびモノマー、生体高分子および OpenGL 分子ビューアーを記述する、オブジェクト指向のデータ構造を解析するための有用なソフトウェア コンポーネントの範囲を提供しています。!MmLib データ モデルは、NMR 蛋白質結晶構造解析のための高度なアプリケーション プログラムの実装に必要な詳細の様々 なレベルに簡単にアクセスを提供するために設計されています、モデリングおよび可視化します。これは蛋白質、DNA、アミノ酸および核酸のための特別なクラスが含まれます。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2012-07-20 22:10
REMITT

REMITT 電子医療情報等の翻訳とトランス ミッションは、スタンドアロンの電子医療課金ソリューションです。任意の特定の電子医療記録 (EMR) または練習管理 (PM) システムから独立して動作し、その API を実装する任意の電子カルテまたは PM システムとインタ フェースすることができます。これを行うに最初のシステムは、FreeMED です。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2013-10-14 22:30
SimThyr

!SimThyr は下垂体-甲状腺系のフィードバック制御のための連続的なシミュレーション プログラムです。このプログラムのアプリケーションは、生物学、医学、看護師、および患者の仮説の開発と学生の教育を含む研究をカバーします。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2014-02-02 18:53
MIRA

ミーラ - 配列アセンブラーと全ゲノム散弾銃および米国東部標準時刻のマッパー/RNASeq シーケンス データ。サンガー、454 を使用することができますイルミナおよび !IonTorrent データ。!PacBio: CCS と ecCLR データ、使用可能な CLR はまです。

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Activity Percentile: 98.62
Activity Ranking: 7,668
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LastUpdate: 2014-04-08 09:06
XMLPipeDB

XMLPipeDB はデータの最低限のマニュアル処理と XML ソースからリレーショナル データベースを構築するためのツールのスイートです。適用性は、一般的な我々 のモチベーションはさまざまなソースからの生物学的データの管理を容易にだった。

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Activity Percentile: 99.40
Activity Ranking: 3,361
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LastUpdate: 2014-04-11 01:29
Bowtie

Bowtieは、次世代シーケンサーから短いDNA配列(の読み取り)のための超高速でメモリ効率の良いリードアライナです。

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Activity Percentile: 99.96
Activity Ranking: 227
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LastUpdate: 2013-01-12 17:30
APBS

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

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Activity Percentile: 98.84
Activity Ranking: 6,459
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LastUpdate: 2001-01-30 06:12
EGO

自我はシーケンシャル コンピューター上だけでなく、並列分子動力学シミュレーションを実行するプログラムです。サポートされている並列マシン日立 SR8000、CRAY T3E、IBM SP2、富士通 VPP700、PARIX、および UNIX ワークステーション PVM や MPI の下での不均質クラスターであり CC などがあります。自我も順次実行しますどんなまともな UNIX ワークステーションも windows 95/NT PC の (GNU C コンパイラ) を使用できます。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2008-11-19 13:41
Java Machine Learning Library

Java Machine Learning Library(Java機械学習ライブラリ)は、機械学習アルゴリズムの参照実装の集まりです。どのアルゴリズムも、ソースコード中とドキュメントサイト上との両方で、きちんと文書化されています。実際の機械学習アルゴリズムに加えて、多数の支援アルゴリズムが含まれています。例えば、距離計測、評価基準、検証用データセットなどです。サンプルコードも含まれています。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2001-06-06 10:28
Genpak

Genpak はプロセス DNA、RNA、指定ユーティリティの小さいセットと非常に国連におけるタンパク質シーケンス * x のような方法。このように、簡単に CGI スクリプトに組み込むだけでなく、パイプやリダイレクトを使用する Genpak プログラムを結合できます。ユーティリティ GC の内容、Tm、DNA/蛋白質シーケンス、迅速なシーケンス検索、乱数列の生成に rna を翻訳を計算するためのプログラムなどを見つけるプロモーター ヘルツ行列を使用してシーケンスします。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2003-04-21 10:15
DPROG

DPROGは動的計画法アルゴリズムを特徴づけるドメイン固有言語です。問題の再帰定義が与えられると、コンパイラは問題を解く動的計画法を使うコードを生成します。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2004-01-05 16:30
Cluster Installation Finishing Scripts

クラスターのインストールの仕上げスクリプト処理 convienent も可能な既存のクラスターのインストール方法を使用できない可能性がある特定のインストール後の構成。通常のインストール プロセスが合理的に構成されているノードのビルドに使用されるとシステムを通常モードで再起動、ネットワーク可視性を実現し、仕上げのスクリプトを実行します。仕上げのスクリプトはすべてのパッケージ、またはパッケージ化以外のソフトウェアをインストールする、インストール、設定のホスト/ネットワークの特定のパラメーター/ファイルなどの調整の細かい詳細を処理します。それは 1 つ、簡単に変更できるスクリプトを介して制御されます。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2005-08-24 21:35
Enki

エンキは、高速 2 D 物理モデルに基づくロボットのシミュレータです。シネマティクス、衝突、センサー、および平らな表面にロボットのカメラをシミュレートすることができます。また摩擦の限定的なサポートを提供します。ロボット倍現代デスクトップ コンピューター上でリアルタイムに何百ものグループをシミュレートすることができます。

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LastUpdate: 2005-08-24 21:36
Teem

満たしなさい人工進化実験を行うためのソフトウェア フレームワークです。それは特定、それ進化ロボティクスのための施設の多くを提供します。さまざまなライブラリおよびロボットの群を含む複雑な定常進化実験へのシンプルな Braitenberg 行動の進化から何のための強力なプラットフォームを形成するプログラムと組み合わせることができます。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2005-08-23 10:24
Isotopic Pattern Calculator

IPC (同位体パターン電卓) は化学式またはペプチッド シーケンスの同位体比分布を計算する質量分析のためのツールです。Gnuplot を使用して、結果を視覚化します。

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Activity Percentile: 59.50
2091 projects in result set.
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