Develop and Download Open Source Software

エゴは、プログラム並列にだけでなく、逐次コンピュータを分子動力学シミュレーションを実行することです。サポートされて並列計算機は、PVMかMPIの下で日立SR8000を、クレイ- T3Eは、IBM - SP2では、富士通VPP700、Parsytec - CCのPARIXの下、およびUNIXワークステーションの不均一なクラスタが含まれます。エゴも順次まともなUNIXワークステーション上でも、Windows95/NTのPCはの（GNUのCコンパイラ）で使用することができます実行されます。

Javaの機械学習ライブラリのアルゴリズムを実装の参照セットである機械学習。これらのアルゴリズムは、サイトいるドキュメントの井戸に記載としてソースコードの両方です。学習アルゴリズムに沿ってマシン実、多くの支援アルゴリズムが提供されて：距離尺度、評価基準、検証のためのデータセット、およびいくつかのサンプルコードです。

Magic Gardenは、人工植物の研究室です。Lシステムの植物を作成し、それらをリアルタイムで変更することができます。OpenGLサポートの追加、アニメーション、何種類かの庭エディタが計画されています。

仕上げスクリプトはインストールするためのクラスタもしないかもしれないがconvienent処理の設定をインストール固有のポストのメソッドをインストール可能な使用して既存のクラスタ。通常のインストールプロセスは、システムと、合理的に構成されたノードを使用さにビルドして、通常の再起動モードに可視性を実現するネットワーク、およびスクリプトを実行する仕上げ。仕上げスクリプトは、スクリプトによって変更が容易な単一制御される処理をすべての細かい詳細等はの、ファイルのインストールパッケージまたは非パッケージソフト、調整/パラメータに固有のインストールを設定するホスト/ネット。

エンキは、シミュレータは高速2次元物理ベースのロボット。これは表面がセンサーにシミュレートする映画製作、衝突ができるのカメラやフラットロボットに。また、摩擦のサポートを限定します。これは、コンピュータがデスクトップの最新のに時間リアルタイムよりもできる高速数百回ロボットをシミュレートするグループをします。

CoaSimの成長指数人口の前提変換の下での遺伝子のプロセスを再結合と合体シミュレートするためのツール。これは、効率的に個人与えられた数の祖先組換えグラフを構築し、これを使用して、遺伝子型/ハプロタイプのSNPとマイクロサテライトシミュレートサンプルを。生成されたサンプルは、マーカーすることができます個々の選択で、その後に分離例の状態に応じて、コントロール。ツールは、データをすることができますそれに応じて制御し、例を構築もされる使用する研究会の設定です。

Bioclipseはベンチですリッチクライアントプラットフォームの化学と生物学。これは、ツールキットをケモインフォマティクスのオープンソースバイオインフォマティクス提供へのアクセスを多くし、BioJavaと、プラグインがのために化学開発キット、ねらったJmolは。

クイック参加隣人に参加をスピードアップするため、隣人可能な分類群の大規模なセットのために参加する意思ヒューリスティックを実装します。推論されるツリーには、ツリーには、伝統的な隣人に参加する方法で推論されるが、発見されます（可能性）を大幅に高速化ツリーを構築すると同一です。

プロアクティブ並列分散のためのJavaライブラリ、および並列コンピューティングだけでなく、モビリティとセキュリティを均一なフレームワークです。それは、包括的なAPIやグラフィカルなインタフェースを提供するアクティブオブジェクトパターンは、独自のスクリプトは、着信要求のサーバーとリモートアクセス可能なオブジェクトは、非同期の活動として、スレッドは、俳優をカプセル化するための統一された方法に基づいている携帯電話安全なエージェント、およびサーバーとクライアントのインターフェイスを持つコンポーネントです。このアプリケーションは、無線LAN、クラスタでは、イントラネット、またはインターネット上のグリッド上で分散型のプログラミングを簡素化します。

GoFigure2 は、可視化、処理、および多次元顕微鏡コア データ （5 D データ セット） の分析のためのクロス プラットフォーム アプリケーションです。ユーザーことができます画像を視覚化、セグメント セル、3 d で時間を通じて、細胞追跡や細胞系統を生成する部門を検出します。結果は、MySQL データベース バック エンドで格納されます。データを処理すると、セルに基づいてオブジェクト機能定量化されていますでき、並べ替え、色分け、分析のために使用したり外部ツールにエクスポートします。GoFigure2 開発 (シグナリング) 胚 (ゼブラフィッシュおよびマウス) 合成生物学の勉強を含む生物学研究と創薬スクリーニングして開発しました。

SimThyr は、下垂体-甲状腺系のフィードバック制御の連続シミュレーション プログラムです。このプログラムの応用研究、生物学、医学、看護師、および患者の仮説の開発と学生の教育を含むカバーします。

SwisTrack 4 ロボット、人間、動物、カメラまたは録画したビデオ入力ソースとしてを使用してオブジェクトを追跡するための強力なソフトウェアです。USB、FireWire、GigE カメラとして AVI ファイル インターフェイスが含まれています。

The Wild Divine Project's Light Stoneのバイオフィードバック装置を使用してバイオフィードバックデータを監視するためのWindows.NETアプリケーションです。データロギング、複数のグラフ、微弱な信号の自動利得制御をサポートします。

光景がコードジェネレータは、任意のワークフローを実現するWebロボットのユーザー定義のシステムを作成する設定されます。それはストーカーアルゴリズムは、HTMLの構造など、このタスクに基づいてできるWebロボットを生成するバイオインフォマティクスで頻繁です。

Genpakユーティリティの小さなセットは非常にアン* xのような方法でDNAを、RNA、および蛋白質の配列を処理するために指定されます。このように、Genpakプログラムはパイプやリダイレクトを使用して、同様に組み合わせることができます簡単にCGIスクリプトに組み込まれます。ユーティリティは、GCの内容を、Tmは、タンパク質のアミノ酸配列、迅速なシーケンス検索、ランダムシーケンスの生成にDNA / RNAのシーケンスを変換計算するためのプログラム、およびプロモーター配列をヘルツ行列を使用して見つけることが含まれます。

DPROGは動的計画法アルゴリズムを特徴づけるドメイン固有言語です。問題の再帰定義が与えられると、コンパイラは問題を解く動的計画法を使うコードを生成します。

心電図解析は、RTLabなどのアナログ入力データ集録データ上で使用するためのグラフィカルなデータ解析ツールです。これは、'。NDSの'ファイル形式RTLabのデータ収集プログラムによって作り出さDAQSystemを開くのに便利です（これも開くことができる通常のASCIIファイル）。脇から汎用的なマルチチャネルのアナログデータを編集するためのツールである、それも心臓のデータを分析するためのカスタム機能を便利含まれています。しかし、それを編集するために使用することができます/一般的な視聴目的のデータも同様に。また、このプログラムは'に変換することができます。NDSの'ファイルをASCII形式のデータです。

テアム実験を行って人工進化のためのフレームワークですソフトウェア。これは特に、それはロボットの進化のための設備を提供しますたくさん。これは、ロボットのグループを、さまざまなことができることが結合を含む実験定常状態の進化の複雑な現象のBraitenbergの単純なものから進化の何かのライブラリやプログラムへの形成のためのプラットフォームを強力です。

QDistパッケージには、木無根進化実装Oのログは（n ^{2の距離の間四メソッドの計算時間の2 nを）。}

IPCは（同位体パターン計算）指定された化学式またはペプチドシーケンスの同位体分布を計算質量ためのツールです。これは、gnuplotの結果を可視化するために使用。