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308 projects in result set
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LastUpdate: 2014-08-06 16:24

PeptideManager_LRNO

!PeptideManager は、ターゲットを絞ったプロテオミクス手法の設計のためのユニークなペプチド配列の事前選択を支援する目的です。その主な利点はこのペプチッド シーケンスの選択中にホスト/背景プロテオーム (例えば、異種移植サンプル) の存在をようにします。!PeptideManager は様々 な公開リポジトリ !SwissProt/が震えて/!UniProt、!RefSeq (IPI) と様々 なプロテアーゼのペプチッド シーケンス データベースを構築できます。

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Database Environment: SQLite
Development Status: 5 - Production/Stable
Intended Audience: Science/Research
Programming Language: C#
User Interface: .NET/Mono
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LastUpdate: 2014-07-25 04:18

BAIT

ストランド継承を作成するソフトウェアでストランド Seq シーケンス プロトコルから派生したデータがプロットされます。種特異的なデータを読み取るための基本的なテンプレート フォルダーすることができますソフトウェアの種の範囲を柔軟に対応して。さらに、機能がすぐに自動的に妹を予測も含まれます。 染色分け体交換イベント, とゲノム断片このデータを使用して以前にマップするにマップされていません。

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LastUpdate: 2013-04-25 17:06

QMRF

(例えば下に達する http://tinyurl.com/eureach) 化学物質の規制の評価で量的な構造活動モデル (QSAR) ハザードとリスク評価のプロパティの予測にますます重要な役割を遊んでいます。関連 QSARs を識別し、見積もりや事前計算された見積もりへのアクセスがあるにそれらを使用することができる両方しなければをつまり。これらのニーズを満たすため、JRC QSAR モデル データベースに確立され、http://qsardb.jrc.it から自由にアクセスできます。QSAR モデル レポートの形式 (QMRF) は、検証研究の結果を含む QSAR モデルに関する重要な情報を報告をまとめた整合テンプレートです。情報は、検証、原則に従って構成されます。QMRF 形式のモデルについて説明し、データベースに含まれているそれらを持っている JRC-IHCP-COMPUTOX@ec.europa.eu を説明を送信するために QMRF エディター http://tinyurl.com/qmrfeditor をダウンロードします。Http://qmrf.sf.net 以上

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LastUpdate: 2012-05-25 08:16

RAndom Network GEnerator

範囲: ランダムな遺伝子の転写ネットワークの生成ネモ言語では、ときにコンパイル システム生物学のマークアップ言語で出力モデル。合成マイクロ アレイ データを生成したり、ネモ SBML ize、ネットワークを単独で使用して cytoscape で視覚化します。

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LastUpdate: 2011-05-07 00:40

TASE: Illumina Solexa annotation

アノテーションと次世代イルミナ Solexa データセットのタグ棚卸のためのバイオインフォマティクス ツールです。田瀬取り扱い CASAVA 1.0 ビルド、注釈、タグ カウント、および可視化を提供する迅速な方法で。

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LastUpdate: 2005-07-13 04:26

LineageEvolver

!LineageEvolver は分子進化のシミュレーション システムです。シーケンスの進化は、置換、遺伝子重複/死、遺伝子の水平伝達などのモジュール式のプロセスを使用してシミュレートされます。

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LastUpdate: 2009-06-05 09:53

Physics and Math Applets

物理学と数学の原則を示すために使用されるアプレットのコレクションです。アプレットが含まれます: アプレット, ディスク アプレットの衝突,、電磁フィールド マッパーと 3 d 水素の軌道シミュレーションの光線の作図。

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LastUpdate: 2010-04-27 22:26

NMRShiftDB

NMRShiftDB は、化学構造と核磁気共鳴データについては、オープン ソース、オープン アクセス、オープン提出、オープン コンテンツの web データベースです。

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LastUpdate: 2014-05-30 03:11

HYBRYD

このプロジェクトは、私は接着剤と呼ばれるして 2005 年に作成されたことは、初期プロジェクトの書き換えです。それをよい Python 2.7.3 と [/projects/freshmeat_gcc/ GCC] 4.6.3 ライブラリする必要がありますを使用して単純な Python 拡張モジュールとして構築しようとしている > python setup.py をインストールし、サーバー、クライアント、または Ipv6 プロトコルを使用して (TCP/UDP) を hybryds (クライアント サーバー) の別の種類を作成することができます。コードのアーキテクチャは、ニューロンのアーキテクチャに基づいています。コードをダウンロードすることができますように利用できるだけ早く (1 つまたはそれ以上私のワイヤレス ネットワーク カード) でアクティブな IPv6 アドレスを置くが。

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LastUpdate: 2014-07-03 09:11

SASfit

SASfit 分析の小角散乱データのプロットに書かれています。それは旋回、散乱不変、前処理定数の半径のような整数の構造パラメーターを計算できます。さらにそれは別の構造要素を含むいくつかのフォーム ファクターとサイズ分布を合うことができます。さらに、アルゴリズムが実装されました (グローバル) パラメーターの共通セットを持ついくつかの散乱曲線を同時にフィットすることができます。この最後のオプションは、対照的に、変化の実験や計測偏中性子特に重要です。グローバル フィット fit パラメーターを明確に決定することができますまたは 1 つのカーブの分析はそれ以外の場合強相関します。SASfit ユーザー ガイド: http://youtube.com/sasfitteam

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LastUpdate: 2006-08-09 20:05

Circadian Modelling

概日時計を構成する遺伝子ネットワークのシミュレーションを実行するためのユーザーフレンドリーなインターフェイスです。モジュールにより、マウスを数回クリックするだけで実験プロトコルのシミュレーション。ユーザーに特別な関心を合わせてシミュレーションを微調整できます。

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LastUpdate: 2011-01-18 09:43

vancouvershortr

このパッケージは短い読み取り DNA シーケンシング技術で使用するためのコードが含まれているし、チップ Seq、シーケンス処理全体トランスクリプトーム散弾銃、全ゲノムの散弾銃の配列、SNP 検出、転写産物発現およびファイル変換パッケージが含まれています。

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LastUpdate: 2008-08-20 14:43

Protein Geometry Database

タンパク質ジオメトリ データベース蛋白質ジオメトリとしてこのタンパク質モデリング & 洗練されたプログラムのデータにアクセスするためのライブラリを検索するための柔軟なデータベースの開発コードをホストします。

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wavelet_contact_potential_predictor

ウェーブレット変換とaaindex データベースで報告された統計的接触電位のセットによる分解に基づく、タンパク質配列を予測する手法。

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LastUpdate: 2014-01-14 23:34

Open3DGRID

分子間相互作用 (Mif) の高速生成を目的とした、オープン ソース ソフトウェア

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