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308 projects in result set
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LastUpdate: 2013-07-04 05:01

psicode

PSI は分子特性の高精度を ab initio を量子力学モデルの計算のためのオープン ソース プログラムです。

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LastUpdate: 2010-09-21 15:32

SPADE

構造プロテオミクス アプリケーション開発環境は、バイオインフォマティクスのアプリケーション開発および展開のための Python ツール キットです。グラフィックス、分析、および蛋白質の順序と構造のモデル化を処理します。利用可能なソースと勝利のインストーラー。

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LastUpdate: 2013-12-21 01:54

Avogadro

Avogadroは、計算化学、分子モデリング、バイオインフォマティクス、材料科学、およびそれらの関連分野で使用するための高度でクロスプラットフォームな分子エディタです。柔軟なレンダリングのフレームワークと強力なプラグインアーキテクチャを提供しています。

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LastUpdate: 2008-02-03 05:37

Biohack

オープン ソース、無料 DIY のバイオ テクノロジー/biohacking キットをブートス トラップします。遺伝子工学療法、!BioBricks、合成生物学 - 回路図、チュートリアル、等。

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LastUpdate: 2007-11-01 22:20

NAcMoS ( Nucleic Acid Modeling System )

プログラム NAcMoS (核酸モデリング システム) は重み付きグラフとして表される Rna の自然分類につながるソフトウェア パッケージです。

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LastUpdate: 2014-06-20 04:37

gMol

gMolは、分子構造や表面のような科学的データの3次元モデルを表示、操作するために使用される対話的可視化システムです。OpenGLと、柔軟なユーザーインターフェースのウェブブラウザウィジェットが含まれます。

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LastUpdate: 2008-11-22 01:23

4DiCeS

4 次元の細胞シミュレータ (4DiCeS) は 4 d セル (全体) 環境のハイブリッド (確率的および確定的な) のモデリングとシミュレーションのフレームワークです。フレームワークは、4 D グリッド レイアウトに適用可能な任意の反応と拡散のアルゴリズムを組み込むことができます。

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LastUpdate: 2005-10-22 11:39

Molevolve

Molevolve はアミノ酸からペプチド鎖の構造を 3次元モデルに遺伝的アルゴリズムを実行する Java ライブラリです。クライアント コードは、独自のペプチド鎖モデル、フィットネス関数および GA 操作を指定できます。JDK 1.5 が必要です。

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LastUpdate: 2007-01-28 08:54

PyMOlyze

PyMOlyze 量子化学 (HF/DFT) 計算の結果を分析するグラフィカル プログラムです。様々 な人口分析、フラグメント解析、構造最適化、およびシンプルな中に監視が備わっていますが、強力な XYZ エディター。

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Development Status: 5 - Production/Stable
Intended Audience: Science/Research
Natural Language: English
Operating System: OS Independent
Programming Language: C++, Python
User Interface: Qt
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LastUpdate: 2006-08-07 00:45

Protein Folding by Genetic Algorithms

遺伝的アルゴリズムによる蛋白質の折畳み蛋白質の既知アミノ酸シーケンスのみを使用してタンパク質立体構造予測する進化的計算法を使用します。

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Database Environment: Flat-file
Development Status: 5 - Production/Stable
Intended Audience: Education
Natural Language: Greek
Operating System: Windows, Windows XP
Programming Language: Visual Basic .NET
User Interface: .NET/Mono
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LastUpdate: 2006-03-14 17:07

ea-fold

ea 倍は進化的アルゴリズムによるタンパク質の折り畳みシミュレーションを実行するプラットフォームです。プログラムは並列分散進化的アルゴリズムと柔軟なフォース フィールドを実装します。

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LastUpdate: 2009-08-27 03:24

Vimes

Vimes: 分子に材料シミュレーション、オープン ソースへのビジュアルインタ フェース python/オープン GL インターフェイスおよび材料シミュレーション プログラム

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LastUpdate: 2011-01-20 23:29

PocketAnalyzerPCA

!PocketAnalyzerPCA タンパク質のポケットを検出する主成分分析とクラスタ リングの幾何学的アルゴリズムを組み合わせたものです。これにより蛋白質の構造の大規模なセットのポケット構造分布の解析と可視化できます。

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LastUpdate: 2014-03-28 10:37

SIMtoEXP

シミュレーション実験のシミュレーション密度情報の直接比較は x 線と中性子から得られる散乱実験、シミュレーション データをフォームの要因に変換することによって可能にするソフトウェアです。また、充填容積モデル スペースに従ってボリューム確率分布を計算します。C++ および Qt で書かれ、SIMtoEXP インタラクティブなプロットを非常にシンプルで使いやすい GUI があります。ソフトウェアは、もともとノルベルト Kucerka によって開発されました。

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LastUpdate: 2014-08-06 16:24

PeptideManager_LRNO

!PeptideManager は、ターゲットを絞ったプロテオミクス手法の設計のためのユニークなペプチド配列の事前選択を支援する目的です。その主な利点はこのペプチッド シーケンスの選択中にホスト/背景プロテオーム (例えば、異種移植サンプル) の存在をようにします。!PeptideManager は様々 な公開リポジトリ !SwissProt/が震えて/!UniProt、!RefSeq (IPI) と様々 なプロテアーゼのペプチッド シーケンス データベースを構築できます。

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Database Environment: SQLite
Development Status: 5 - Production/Stable
Intended Audience: Science/Research
Programming Language: C#
User Interface: .NET/Mono