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Topic
    Scientific/Engineering
        Molecular Science

305 projects in result set.
Displaying 20 per page. Projects sorted by activity ranking.

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LastUpdate: 2006-03-14 12:56
ea-fold

ea 倍は進化的アルゴリズムによるタンパク質の折り畳みシミュレーションを実行するプラットフォームです。プログラムは並列分散進化的アルゴリズムと柔軟なフォース フィールドを実装します。

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Activity Percentile: 58.60
Activity Ranking: 107,816
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LastUpdate: 2009-08-26 20:24
Vimes

Vimes: 分子に材料シミュレーション、オープン ソースへのビジュアルインタ フェース python/オープン GL インターフェイスおよび材料シミュレーション プログラム

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Activity Percentile: 86.78
Activity Ranking: 73,698
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LastUpdate: 2011-01-20 15:29
PocketAnalyzerPCA

!PocketAnalyzerPCA タンパク質のポケットを検出する主成分分析とクラスタ リングの幾何学的アルゴリズムを組み合わせたものです。これにより蛋白質の構造の大規模なセットのポケット構造分布の解析と可視化できます。

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Activity Percentile: 83.61
Activity Ranking: 91,374
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LastUpdate: 2014-03-28 03:37
SIMtoEXP

シミュレーション実験のシミュレーション密度情報の直接比較は x 線と中性子から得られる散乱実験、シミュレーション データをフォームの要因に変換することによって可能にするソフトウェアです。また、充填容積モデル スペースに従ってボリューム確率分布を計算します。C++ および Qt で書かれ、SIMtoEXP インタラクティブなプロットを非常にシンプルで使いやすい GUI があります。ソフトウェアは、もともとノルベルト Kucerka によって開発されました。

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LastUpdate: 2013-04-08 22:10
BAIT

ストランド継承を作成するソフトウェアでストランド Seq シーケンス プロトコルから派生したデータがプロットされます。種特異的なデータを読み取るための基本的なテンプレート フォルダーすることができますソフトウェアの種の範囲を柔軟に対応して。さらに、機能がすぐに自動的に妹を予測も含まれます。 染色分け体交換イベント, とゲノム断片このデータを使用して以前にマップするにマップされていません。

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LastUpdate: 2013-04-25 10:06
QMRF

(例えば下に達する http://tinyurl.com/eureach) 化学物質の規制の評価で量的な構造活動モデル (QSAR) ハザードとリスク評価のプロパティの予測にますます重要な役割を遊んでいます。関連 QSARs を識別し、見積もりや事前計算された見積もりへのアクセスがあるにそれらを使用することができる両方しなければをつまり。これらのニーズを満たすため、JRC QSAR モデル データベースに確立され、http://qsardb.jrc.it から自由にアクセスできます。QSAR モデル レポートの形式 (QMRF) は、検証研究の結果を含む QSAR モデルに関する重要な情報を報告をまとめた整合テンプレートです。情報は、検証、原則に従って構成されます。QMRF 形式のモデルについて説明し、データベースに含まれているそれらを持っている JRC-IHCP-COMPUTOX@ec.europa.eu を説明を送信するために QMRF エディター http://tinyurl.com/qmrfeditor をダウンロードします。Http://qmrf.sf.net 以上

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LastUpdate: 2012-02-16 20:34
libcfp

化学式解析ライブラリです。構文、セマンティクス。ない外部のライブラリの依存関係、名前空間 std:: のみ。単体テスト + + 開発時に一貫性のある行動を確保するために使用します。

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LastUpdate: 2012-05-25 01:16
RAndom Network GEnerator

範囲: ランダムな遺伝子の転写ネットワークの生成ネモ言語では、ときにコンパイル システム生物学のマークアップ言語で出力モデル。合成マイクロ アレイ データを生成したり、ネモ SBML ize、ネットワークを単独で使用して cytoscape で視覚化します。

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Activity Percentile: 67.62
Activity Ranking: 84,314
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LastUpdate: 2011-05-06 17:40
TASE: Illumina Solexa annotation

アノテーションと次世代イルミナ Solexa データセットのタグ棚卸のためのバイオインフォマティクス ツールです。田瀬取り扱い CASAVA 1.0 ビルド、注釈、タグ カウント、および可視化を提供する迅速な方法で。

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Activity Percentile: 97.36
Activity Ranking: 14,698
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LastUpdate: 2005-07-12 21:26
LineageEvolver

!LineageEvolver は分子進化のシミュレーション システムです。シーケンスの進化は、置換、遺伝子重複/死、遺伝子の水平伝達などのモジュール式のプロセスを使用してシミュレートされます。

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Activity Percentile: 66.77
Activity Ranking: 86,544
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LastUpdate: 2009-06-05 02:53
Physics and Math Applets

物理学と数学の原則を示すために使用されるアプレットのコレクションです。アプレットが含まれます: アプレット, ディスク アプレットの衝突,、電磁フィールド マッパーと 3 d 水素の軌道シミュレーションの光線の作図。

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Activity Percentile: 97.31
Activity Ranking: 7,018
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LastUpdate: 2010-04-27 15:26
NMRShiftDB

NMRShiftDB は、化学構造と核磁気共鳴データについては、オープン ソース、オープン アクセス、オープン提出、オープン コンテンツの web データベースです。

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Activity Percentile: 81.71
Activity Ranking: 101,970
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LastUpdate: 2013-05-17 18:25
HYBRYD

このプロジェクトは、私は接着剤と呼ばれるして 2005 年に作成されたことは、初期プロジェクトの書き換えです。それをよい Python 2.7.3 と [/projects/freshmeat_gcc/ GCC] 4.6.3 ライブラリする必要がありますを使用して単純な Python 拡張モジュールとして構築しようとしている > python setup.py をインストールし、サーバー、クライアント、または Ipv6 プロトコルを使用して (TCP/UDP) を hybryds (クライアント サーバー) の別の種類を作成することができます。コードのアーキテクチャは、ニューロンのアーキテクチャに基づいています。コードをダウンロードすることができますように利用できるだけ早く (1 つまたはそれ以上私のワイヤレス ネットワーク カード) でアクティブな IPv6 アドレスを置くが。

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LastUpdate: 2014-02-05 17:08
SASfit

SASfit 分析の小角散乱データのプロットに書かれています。それは旋回、散乱不変、前処理定数の半径のような整数の構造パラメーターを計算できます。さらにそれは別の構造要素を含むいくつかのフォーム ファクターとサイズ分布を合うことができます。さらに、アルゴリズムが実装されました (グローバル) パラメーターの共通セットを持ついくつかの散乱曲線を同時にフィットすることができます。この最後のオプションは、対照的に、変化の実験や計測偏中性子特に重要です。グローバル フィット fit パラメーターを明確に決定することができますまたは 1 つのカーブの分析はそれ以外の場合強相関します。SASfit ユーザー ガイド: http://youtube.com/sasfitteam

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Activity Percentile: 98.81
Activity Ranking: 6,627
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LastUpdate: 2006-08-09 13:05
Circadian Modelling

概日時計を構成する遺伝子ネットワークのシミュレーションを実行するためのユーザーフレンドリーなインターフェイスです。モジュールにより、マウスを数回クリックするだけで実験プロトコルのシミュレーション。ユーザーに特別な関心を合わせてシミュレーションを微調整できます。

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Activity Percentile: 75.28
Activity Ranking: 64,362
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LastUpdate: 2008-08-20 07:45
Protein Geometry Database

タンパク質ジオメトリ データベース蛋白質ジオメトリとしてこのタンパク質モデリング & 洗練されたプログラムのデータにアクセスするためのライブラリを検索するための柔軟なデータベースの開発コードをホストします。

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Activity Percentile: 31.16
Activity Ranking: 383,778
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LastUpdate: 2013-12-19 16:29
wavelet_contact_potential_predictor

法は、aaindex データ ベースで報告されたウェーブレット変換と統計的接触電位のセットによって分解に基づくタンパク質配列を予測します。

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Activity Percentile: 0.00
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LastUpdate: 2014-01-14 15:34
Open3DGRID

分子間相互作用 (Mif) の高速生成を目的とした、オープン ソース ソフトウェア

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Activity Percentile: 93.66
Activity Ranking: 35,338
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LastUpdate: 2011-09-26 21:42
Smoldyn

Smoldyn は、シミュレートする反応とメソスコ ピック サイズの規模で拡散のためのコンピュータ プログラムです。このスケールはより伝統的な顕微鏡サイズのスケールは、すべて、間にあるまたはほとんどの原子と見なされます。

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Activity Percentile: 98.66
Activity Ranking: 7,455
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LastUpdate: 2006-01-13 22:12
2D HF

これは標準的な 2 D HF パッケージに (数値ハートリー ・ フォック プログラム ヤツェク コブシ、Leif Laaksonen、Dage Sundholm による二原子分子の) いくつかの余分な機能を追加する拡張機能です。

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Activity Percentile: 62.10
Activity Ranking: 98,689
305 projects in result set.
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