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Open Babelは、分子モデリング、化学、ファイル形式とデータの相互変換を含む多くの関連する分野をサポートするために設計された、クロスプラットフォームのプログラムと開発者ライブラリの両方を含む、コミュニティ主導の科学プロジェクトです。

Gabedit is a graphical interface for the FireFly, Gamess-US, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, NWChem, OpenMopac, ORCA, and Q-Chem computational chemistry packages. It includes a 3D molecule editor and viewer. Most major molecular file formats are supported, and graphics can be exported in many formats.

uLanドライバは、RS-485リンク上で転送され、9ビットの文字メッセージ指向の通信プロトコルを提供します。物理層は、リード線の1ツイストペア、およびRS-485トランシーバで構成されています。サポートされるハードウェアが含まれていますOX16C954 PCIベースのアドオンカード、USBツーuLanはコンバータ、i82510 RS-485カード、または標準的なPCのRS-232ポートのためのシンプルなアクティブコンバータドングル。ライブラリとサポートツールのセット全体は、組み込みデバイスを構築するために利用可能です。それは、指向特性の閲覧や操作とプロセスデータ通信チャネルマッピングをオブジェクトに、低レベルのファームウェアのブートローダーとデバッグツールからまでの範囲です。

Cactusは、偏微分方程式を解くシステムのための汎用的なモジュラー並列環境です。 このコードは、数値相対論と計算科学研究グループの国際協調によって多くの年月をかけて開発されました。 任意の偏微分方程式解法システムを解くための移植可能なプラットフォームに供するために使用されます。

画面上でグラフィカルに分子モデルを組み立てるソフトウェア。Mac OS X と Windows で動作する。GAMESS, Gaussian などの計算化学ソフトウェアとの連携、組み込み Ruby インタプリタによる自動編集などの機能を持つ。

本プロジェクトは GitHub へ移行しました。今後の更新は GitHub で行い、こちらでは行いません。

GitHub プロジェクトページ： https://github.com/toshinagata/Molby

公式ホームページ： https://toshinagata.github.io/Molby

Ghemicalいくつかの素晴らしい3D可視化ツールを備えた分子モデリングソフトウェアパッケージです。これは分子力学や（MOPAC7、QM用のMPQCを使用した）量子力学の両方に基づくメソッドをサポートしています。（MMやQM用の）構造最適化や（MM用の）分子動力学アルゴリズムが含まれています。GhemicalはC++言語で書かれており、できれば汎用フリーウェアの分子モデリングツールの良いフレームワークを提供します。

BioJavaはバイオインフォマティクスのアプリケーションの迅速な開発のためのJavaコンポーネントの包括的なセットを提供することを目指します。これには、他の重要なバイオインフォマティクスの概念、機能シーケンスを表すためのインターフェイスが含まれます。また、様々な共通フォーマットのシーケンスデータを読み書きし、EnsemblのデータベースとDASとBioCorbaサーバーと通信することができます。

WebGL を利用した分子構造ビューアを開発していきます。Java やプラグインを使わず Webブラウザの機能だけで分子構造を提示できるようにするほか、科学データの可視化における WebGL の有効性を検証します。