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547 projects in result set
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LastUpdate: 2004-05-02 17:42

EasyChem

EasyChemは高品質な分子や化学式を描くように設計されています。 (とりわけ有機分子で。)また多くのフォーマットにエクスポートすることができます。 (例えば、PostScript、LaTeX、Fig)

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LastUpdate: 2005-08-23 10:24

Isotopic Pattern Calculator

IPC (同位体パターン電卓) は化学式またはペプチッド シーケンスの同位体比分布を計算する質量分析のためのツールです。Gnuplot を使用して、結果を視覚化します。

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LastUpdate: 2005-09-07 10:54

Vigyaan

Vigyaanは、バイオインフォマティクス、計算生物学、計算化学のための電子ワークベンチです。これは、必要なソフトウエアをすべて含んだ、LinuxベースのライブCDで、モデリングソフトウエアが、使用する準備ができた状態でコンピュータを起動させることができる。Artemis、Bioperl、 BLAST (NCBI-tools)、 ClustalX、 Cn3D、EMBOSS tools、Garlic、GROMACS、Ghemical、GNU R、Gnuplot、GIMP、ImageMagick、JMol、MPQC、NJPlot、Open Babel、Octave、PSI3、PyMOL、Rasmol、Raster3D、SMILE、TINKER、XDrawChem、Xmgr、Xfigを含みます。

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LastUpdate: 2006-05-19 09:56

Brabosphere

Brabosphere は分子システムとその特性 3 D 可視化のためのプログラムです。その名前は由来量子力学プログラム パッケージ BRABO、それは、グラフィカルなフロント エンドとして機能するため。解析と可視化結果いくつか他の量子力学的アプリケーションからも受け付けておりますので、計算のこのタイプから作成されたデータを使用することもできます。

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LastUpdate: 2006-04-27 01:40

SimSoup

!SimSoup は、[/projects/freshmeat_linux/ Linux] と Windows のグラフィカルな人工化学シミュレータです。プログラムは、分子の種類とそれらの間の可能な相互作用の観点から定義する化学を使用できます。シミュレーション実行は、原子炉で各種分子の分子の数を設定し、場所を取る時間の期間にわたって相互作用を許可する必要があります。リアクターで行われているの相互作用がグラフィカルに表示に表示されます。プログラムの開発のための動機は特にに関連して、ネットワークの行動に調査を有効にする ' 代謝最初」理論生命の起源の基本設計を相互作用の任意のネットワークのモデリングをサポートしていますが起こることができるノード間。現在、開発はプロトタイプ段階に達しています。

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LastUpdate: 2006-11-22 02:35

labTimer

labTimer は黒と白のフィルム加工に適してタイマーのセットです。現時点では、プログラムすることができます開発、修正、および洗濯、アラームと素敵なカウント ダウンの基本的なシーケンスに従ってください。

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LastUpdate: 2006-12-21 09:24

QuteMol

!QuteMol は、インタラクティブな高品質の分子可視化システムです。!QuteMol は革新的な視覚効果の配列を提供する OpenGL シェーダーを通じて現在の Gpu の機能を悪用します。!QuteMol 可視化技術は明快さと三次元形状の理解しやすく、大規模な分子や複雑な蛋白質の構造の改善を目指します。

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LastUpdate: 2007-01-28 22:46

PyMOlyze

PyMOlyze は、量子化学 (DFT) 計算の結果を分析するためのグラフィカル プログラムです。以下の分析は分子のフラグメントをユーザー定義に対応しています: マリケン人口分析 (MPA)、C 乗人口分析 (SCPA)、人口分析の重複、マイヤーの結合の注文。QM パッケージがサポートされますガウス、ADF、GAMESS (米国)、GAMESS (英国) と PCGAMESS。

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LastUpdate: 2007-07-16 04:01

Biomolecule Toolkit

生体分子のツールキットは、生体高分子の構造モデリングのためのオープン ソース ライブラリです。ツールキットは分子モデリング、設計、解析ツールの開発を容易に計算の構造生物学で一般的なタスクのための C++ のインターフェイスを提供します。

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LastUpdate: 2005-01-17 07:37

ProteomeCommons.org Java Analysis Framework

!ProteomeCommons.org Java 分析フレームワークは原子や残渣などの共通の質量分析データを参照するためのフレームワークです。このフレームワークは共通の質量分析データに依存するプログラムを書くを使いやすいライブラリとプログラマを提供します。フレームワークには同位体電卓や残留物の省略のための参照などのユーティリティも含まれています。

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LastUpdate: 2001-03-08 19:05

Jude

ジュードはデータ管理ワークグループ アプリケーションを開発すること維持簡単開発者と使いやすいエンド ・ ユーザーの迅速なアプリケーション開発ツールです。それは、オブジェクト指向の構造、サーバー側とクライアント側で複合ドキュメント エージェント ベースのユーザー インターフェイスで、ナレッジ ベースに基づいています。

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LastUpdate: 2003-04-01 17:32

frowns

しかめ面は化学関連アルゴリズムの急速な発展に向けたケモインフォマティックス ツールキットです。

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LastUpdate: 2004-03-23 17:10

ODPdom

ODPdom は、単純な DOM (ドキュメント オブジェクト モデル) のパーサーです。それは大きな XML ファイルを処理することができます。

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LastUpdate: 2004-08-04 20:24

PhosphoFind

!PhosphoFind を検索し、リン酸化ペプチドを定量化 4 MALDI マススペクトルのセットからの蛋白質でを実行線形正、負、正、リフレクトロン リフレクトロン負とモード線形。

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LastUpdate: 2004-09-24 10:56

Polarizable Fluids Molecular Dynamics

PFMD 分子動力学法の応用への可能性による分極性流体の液体の状態をシミュレートするプログラムです。現在サポートされている分子は水 (H2O) と M が Al、Fe、または Ga と X の間で選ばれた金属 MX3 は Cl、Br、間ハロゲン。

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