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LastUpdate: 2008-01-17 02:05

xmds

XMDS は、方程式を統合コード ジェネレーターです。XML ファイルで人間が読める形式でそれらを書き留めてとそれが治まると書き込みし、アーキテクチャで多分行うことができます高速それらの方程式を統合する C++ プログラムをコンパイルします。

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LastUpdate: 2008-04-20 00:20

Bist

Bist「二次元構造」の略と化学図面ツールです。有機化学に焦点を当てているが、それは化学者や教師でもために有用かもしれない。Bist は、形式主義、単結合、二重結合、立体特異的付着、料金、共鳴矢印、孤立電子対のような分子構造を記述するための多くをサポートします。!PostScript と PNG にエクスポートすることができます形式。

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LastUpdate: 2004-05-02 17:42

EasyChem

EasyChemは高品質な分子や化学式を描くように設計されています。 (とりわけ有機分子で。)また多くのフォーマットにエクスポートすることができます。 (例えば、PostScript、LaTeX、Fig)

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LastUpdate: 2005-08-23 10:24

Isotopic Pattern Calculator

IPC (同位体パターン電卓) は化学式またはペプチッド シーケンスの同位体比分布を計算する質量分析のためのツールです。Gnuplot を使用して、結果を視覚化します。

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LastUpdate: 2005-09-07 10:54

Vigyaan

Vigyaanは、バイオインフォマティクス、計算生物学、計算化学のための電子ワークベンチです。これは、必要なソフトウエアをすべて含んだ、LinuxベースのライブCDで、モデリングソフトウエアが、使用する準備ができた状態でコンピュータを起動させることができる。Artemis、Bioperl、 BLAST (NCBI-tools)、 ClustalX、 Cn3D、EMBOSS tools、Garlic、GROMACS、Ghemical、GNU R、Gnuplot、GIMP、ImageMagick、JMol、MPQC、NJPlot、Open Babel、Octave、PSI3、PyMOL、Rasmol、Raster3D、SMILE、TINKER、XDrawChem、Xmgr、Xfigを含みます。

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LastUpdate: 2006-05-19 09:56

Brabosphere

Brabosphere は分子システムとその特性 3 D 可視化のためのプログラムです。その名前は由来量子力学プログラム パッケージ BRABO、それは、グラフィカルなフロント エンドとして機能するため。解析と可視化結果いくつか他の量子力学的アプリケーションからも受け付けておりますので、計算のこのタイプから作成されたデータを使用することもできます。

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LastUpdate: 2006-04-27 01:40

SimSoup

!SimSoup は、[/projects/freshmeat_linux/ Linux] と Windows のグラフィカルな人工化学シミュレータです。プログラムは、分子の種類とそれらの間の可能な相互作用の観点から定義する化学を使用できます。シミュレーション実行は、原子炉で各種分子の分子の数を設定し、場所を取る時間の期間にわたって相互作用を許可する必要があります。リアクターで行われているの相互作用がグラフィカルに表示に表示されます。プログラムの開発のための動機は特にに関連して、ネットワークの行動に調査を有効にする ' 代謝最初」理論生命の起源の基本設計を相互作用の任意のネットワークのモデリングをサポートしていますが起こることができるノード間。現在、開発はプロトタイプ段階に達しています。

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LastUpdate: 2006-11-22 02:35

labTimer

labTimer は黒と白のフィルム加工に適してタイマーのセットです。現時点では、プログラムすることができます開発、修正、および洗濯、アラームと素敵なカウント ダウンの基本的なシーケンスに従ってください。

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LastUpdate: 2006-12-21 09:24

QuteMol

!QuteMol は、インタラクティブな高品質の分子可視化システムです。!QuteMol は革新的な視覚効果の配列を提供する OpenGL シェーダーを通じて現在の Gpu の機能を悪用します。!QuteMol 可視化技術は明快さと三次元形状の理解しやすく、大規模な分子や複雑な蛋白質の構造の改善を目指します。

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LastUpdate: 2007-01-28 22:46

PyMOlyze

PyMOlyze は、量子化学 (DFT) 計算の結果を分析するためのグラフィカル プログラムです。以下の分析は分子のフラグメントをユーザー定義に対応しています: マリケン人口分析 (MPA)、C 乗人口分析 (SCPA)、人口分析の重複、マイヤーの結合の注文。QM パッケージがサポートされますガウス、ADF、GAMESS (米国)、GAMESS (英国) と PCGAMESS。

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LastUpdate: 2007-07-16 04:01

Biomolecule Toolkit

生体分子のツールキットは、生体高分子の構造モデリングのためのオープン ソース ライブラリです。ツールキットは分子モデリング、設計、解析ツールの開発を容易に計算の構造生物学で一般的なタスクのための C++ のインターフェイスを提供します。

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LastUpdate: 2014-02-04 00:40

LAMMPS

LAMMPSは並列計算機のために設計された古典的な分子動力学シミュレータです。これは様々な力場と境界条件を使用して、原子、高分子、生物、金属、中規模システムのモデルを作ることができます。また、簡単に変更したり拡張することができます。

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LastUpdate: 2014-02-24 16:28

gdis

gdisは、孤立分子、周期構造、結晶性の傾向を表示するためのプログラムであり、GTK/OpenGLをベースとしています。また、GAMESS、GULP、POV-RayなどのGUIをパッケージとして動作し、 エネルギー最小化と発表用品質のレンダリングを提供します。

Development Status: 4 - Beta
Intended Audience: Education, Science/Research
Natural Language: English
Programming Language: C
User Interface: X11 Applications
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LastUpdate: 2005-01-17 07:37

ProteomeCommons.org Java Analysis Framework

!ProteomeCommons.org Java 分析フレームワークは原子や残渣などの共通の質量分析データを参照するためのフレームワークです。このフレームワークは共通の質量分析データに依存するプログラムを書くを使いやすいライブラリとプログラマを提供します。フレームワークには同位体電卓や残留物の省略のための参照などのユーティリティも含まれています。

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LastUpdate: 2001-03-08 19:05

Jude

ジュードはデータ管理ワークグループ アプリケーションを開発すること維持簡単開発者と使いやすいエンド ・ ユーザーの迅速なアプリケーション開発ツールです。それは、オブジェクト指向の構造、サーバー側とクライアント側で複合ドキュメント エージェント ベースのユーザー インターフェイスで、ナレッジ ベースに基づいています。

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