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Topic
    Scientific/Engineering
        Chemistry

538 projects in result set.
Displaying 20 per page. Projects sorted by activity ranking.

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LastUpdate: 2007-07-16 04:01
Biomolecule Toolkit

生体分子のツールキットは、生体高分子の構造モデリングのためのオープン ソース ライブラリです。ツールキットは分子モデリング、設計、解析ツールの開発を容易に計算の構造生物学で一般的なタスクのための C++ のインターフェイスを提供します。

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Activity Percentile: 59.50
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LastUpdate: 2014-02-12 02:56
Motofit

Motofit は共同 Abeles 行列を用いた中性子および x 線反射率データをリファイン Parratt 再帰と最小二乗フィッティング (遺伝的アルゴリズムまたはレーベンバーグ)/。IGOR Pro 環境 (TM Wavemetrics) で動作します。

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Activity Percentile: 98.14
Activity Ranking: 10,388
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LastUpdate: 2014-02-21 10:52
Powder auto-indexing software Conograph

Distribution and user-support of powder auto-indexing software Conograph for academic and educational purpose in crystallography.

Conograph CUI (for Windows OS with English / Japanese instructions) and BLDConograph (a standalone program for error-stable Bravais lattice determination) are uploaded here. Conograph is based on the method introduced in Acta Cryst., A69, 603--610 (2013). The algorithm of BLDConograph which is also used in Conograph is based on the method in Acta Cryst. A68, 525--535 (2012).

Distribution of Conograph GUI (for Windows OS with Japanese documents) started in another web site http://research.kek.jp/people/rtomi/ConographGUI/web_page.html (4/30/2013).

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Activity Percentile: 0.00
Register Date: 2012-08-05 15:29
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LastUpdate: 2005-01-17 07:37
ProteomeCommons.org Java Analysis Framework

!ProteomeCommons.org Java 分析フレームワークは原子や残渣などの共通の質量分析データを参照するためのフレームワークです。このフレームワークは共通の質量分析データに依存するプログラムを書くを使いやすいライブラリとプログラマを提供します。フレームワークには同位体電卓や残留物の省略のための参照などのユーティリティも含まれています。

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LastUpdate: 2003-04-01 17:32
frowns

しかめ面は化学関連アルゴリズムの急速な発展に向けたケモインフォマティックス ツールキットです。

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LastUpdate: 2004-03-23 17:10
ODPdom

ODPdom は、単純な DOM (ドキュメント オブジェクト モデル) のパーサーです。それは大きな XML ファイルを処理することができます。

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LastUpdate: 2004-08-04 20:24
PhosphoFind

!PhosphoFind を検索し、リン酸化ペプチドを定量化 4 MALDI マススペクトルのセットからの蛋白質でを実行線形正、負、正、リフレクトロン リフレクトロン負とモード線形。

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LastUpdate: 2004-09-24 10:56
Polarizable Fluids Molecular Dynamics

PFMD 分子動力学法の応用への可能性による分極性流体の液体の状態をシミュレートするプログラムです。現在サポートされている分子は水 (H2O) と M が Al、Fe、または Ga と X の間で選ばれた金属 MX3 は Cl、Br、間ハロゲン。

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LastUpdate: 2006-03-07 10:29
lazar

lazar (Lazy 構造活性相関) は化学構造の有毒な活動予測のためのツールです。ハンセン病患者予測実験毒性データを持つデータベースから派生しています。これらのデータベースに類似した構造を有する化合物を検索しの測定の活動からの予測を計算します。

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LastUpdate: 2006-07-10 07:06
kfile_chemical

kfile_chemical は化学ドキュメントからメタデータを抽出する KDE デスクトップ用の kfile プラグインのセットです。このメタデータは Kat のようなデスクトップ検索エンジンによって使用することができます。PDB ファイル、MDL mol/sd, 慢性骨髄性白血病、発生してしまうと CIF ファイルをサポートしています。

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LastUpdate: 2007-02-16 13:42
chemicalInventory

chemicalInventory は、化学の在庫を管理するためのインテリジェントなツールです。下部組織またはテキスト検索を介して化学物質を見つける管理コンテナーと棚の場所、容器チェックインおよびチェック アウト、またはユーザー間転送コンテナーをできます。

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LastUpdate: 2007-01-28 22:46
PyMOlyze

PyMOlyze は、量子化学 (DFT) 計算の結果を分析するためのグラフィカル プログラムです。以下の分析は分子のフラグメントをユーザー定義に対応しています: マリケン人口分析 (MPA)、C 乗人口分析 (SCPA)、人口分析の重複、マイヤーの結合の注文。QM パッケージがサポートされますガウス、ADF、GAMESS (米国)、GAMESS (英国) と PCGAMESS。

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LastUpdate: 2007-04-08 17:44
PyVib2

!PyVib2 は、ラマン散乱、ラマン光学活性 (ROA)、赤外線振動吸収 (IR)、振動円二色性 (VCD) スペクトルの理解により分子の振動の動きの自動相関を許可します。振動動き、分子にラマン/ROA と IR/VCD 生成の可視化技術とパブリケーション品質スペクトルの生産の汎用性の高い表現 !PyVib2 の機能です。ラマン/ROA との IR/VCD 計算、ダルトンとガウス量子化学パッケージで生成された出力ファイルを直接開くことができます。モルデンと XMol XYZ の形式でファイルをインポートおよびエクスポートすることができます。結果を保存するため、さまざまな形式 (JPEG、TIFF、PNG、PNM、PS、pdf ファイル、GIF、および FLI) はユーザーが利用できます。すべての機能は pyviblib クラス ライブラリを介してアクセスできます。

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LastUpdate: 2012-02-13 23:31
Mychem

ケミカルは、[/projects/freshmeat_mysql/ MySQL] データベース内の化学データを処理することを許可する関数のセットを提供する拡張です。

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LastUpdate: 2010-12-12 20:11
Indigo

インディゴは普遍的な有機化学ツールキットです。開発者向けのエンドユーザーとドキュメント化された API のツールが含まれます。それは GGA ソフトウェア サービスが開発したユニークなアルゴリズムとして、ケモインフォマティックスの世界でよく知られているいくつかの標準のアルゴリズムの数が組み込まれていますケモインフォマティックス ライブラリに基づいています。API は、C/Java に藍を統合する開発者ことができます/C #/Python プロジェクト。2 つの藍ベースの Java GUI アプリケーションを提供しています: 第 (コンビナトリアルケミストリー) と chemdiff (2 つの自衛隊または笑顔ファイルの視覚的比較)。平野の C で書かれた 3 つの藍ベースのコマンド ライン ユーティリティが用意されて: インディゴ-(分子と反応のレンダリング ユーティリティ) を描く、インディゴ カノ (正規笑顔ジェネレーター) とインディゴ-デコ (R グループ デコンボリューション ユーティリティ)。

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LastUpdate: 2011-11-12 21:08
OpenChrom

!OpenChrom アジレント ・ テクノロジーからの !ChemStation と同様の方法でのクロマトグラフィー データの質量分析を提供します。などさまざまな液体クロマトグラフィー/質量、GC/MS システム ・ ベンダーからデータ ファイルを処理 (*。アジレント · テクノロジー · フィニガン ITS40 から D) クロマト グラム (*.ms)、NetCDF (*.cdf)、MzXML (*.mzxml)、および他のフォーマット。柔軟性とプラグインによって拡張することができます。

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LastUpdate: 2011-05-06 23:05
chemkit

Chemkit 分子モデリング、ケモインフォマティックス、分子可視化用の C++ ライブラリです。

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LastUpdate: 2013-07-10 21:35
Toxtree: Toxic Hazard Estimation

化学物質の毒性の危険性を推定する GUI アプリケーションです。最新バージョンは、次の毒性予測モジュールを含む:-Cramer のルール (経口毒性) - Verhaar を介してアクションの毒性モード スキーム - 皮膚の炎症や目の炎症の予測 - ベニーニ/ボッサ ルールベースの変異原性および発がん性の予測-開始の生分解性と永続性の予測-皮膚感反応性ドメイン - クルースは TTC デシジョン ツリー - SMARTCyp - Cytochrome P450-Mediated 薬物代謝と代謝予測-in vivo 小核試験の構造警告アッセイの齧歯動物 (ISSMIC) で-構造アラート機能グループ識別 (ISSFUNC)-結合蛋白結合に関連する構造のアラートDNA の結合。-Ames 変異原性 Toxtree を推定への異なるアプローチを組み込むプラグイン フレームワークを提供します。プラットフォームに依存しない (Java で書かれた) 化学開発キットを使って。

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Activity Percentile: 99.34
Activity Ranking: 3,679
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LastUpdate: 2014-04-14 21:45
SASHIMI

刺身プロジェクト ホスト トランス プロテオーム パイプライン (TPP)、基づく量産仕様 (MS、MS/MS) のためのツールの成熟したスイート プロテオミクス: 統計的検証、定量、視覚化、および私たちのオープン mzXML 形式に raw の MS データからコンバーター。

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Activity Percentile: 99.78
Activity Ranking: 1,214
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LastUpdate: 2014-02-24 06:22
Cantera

Canteraは、化学反応速度、熱力学、輸送プロセスといった問題のためのオブジェクト指向のソフトウェアスイートです。Matlab, Python, C++, Fortranを使用しています。

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Activity Percentile: 83.71
Activity Ranking: 90,835
538 projects in result set.
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