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プロジェクト概要

Subread ソフトウェア パッケージは、次世代シーケンサーのデータを処理するためのツール キットです。Subread アライナには、Subjunc エクソン エキソン接合検出器には featureCounts 要約を読むプログラムが含まれます。Subread のアライナは gDNA seq と RNA シーケンシャル ・ リードを配置する使用ことができます。Subjunc アライナ エクソン エキソンジャンクションの検出のために設計されました。RNA シーケンシャル ・ リードのマッピングを Subread 局所アライメントを実行する Subjunc を世界的な配置を実行します。Subread と Subjunc は、次のペーパーで出版された: 遼陽、ゴードン ・ K ・ スミスと魏市。"Subread のアライナ: 種子の投票による高速、正確かつスケーラブルな読み取りマッピング」、核酸の研究、2013 年 41 (10): e108