Rootkit Hunterはファイルおよびシステムの既知および未知のルートキット/バックドア/スニッファ/マルウェアをスキャンします。アプリケーションはメインのシェルスクリプト、いくつかのテキストベースのデータベース、およびオプションのPerlスクリプトで構成されます。skdetやunhideのように外部アプリケーションを認識・実行することができます。これはほとんどすべてのUnixクローン上で実行すべきです。